Het thema van de Job Dura Prijs, een prijs voor architectuur, stedenbouw en maatschappij, wordt elke twee jaar vastgesteld door het bestuur van de stichting. Om de prijs ook echt van betekenis te laten zijn, wordt voor het thema gezocht binnen de actualiteit van de bebouwde omgeving in de regio Rotterdam. De serie Job Dura Prijzen zal representatief zijn voor de geschiedenis van markante vraagstukken of aandachtspunten in de regio Rotterdam. De prijs bestaat uit een kunstobject dat speciaal voor de stichting is ontworpen door Bruno Ninaber van Eyben en een geldbedrag. Aan het winnende project wordt de Job Dura Prijs gegund van € 25.000,-. Daarnaast werd in het jaar 2008 voor de eerste keer de Aanmoedigingsprijs ter waarde van € 7.500,- uitgereikt. In beide gevallen is het bedrag bedoeld ter besteding aan iets blijvends in het winnende project.